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标题: 样品聚类分析中对距离的定义 [打印本页]

作者: shiyiming 时间: 2008-11-2 14:52
标题: 样品聚类分析中对距离的定义
我在sas程序进行样品聚类分析时，想使用卡方距离(chi-square distance)这种距离系数和最短距离法（Single Linkage)做系统聚类分析，但不知道在程序中如何加入距离系数选项。请大家帮忙，谢谢！

作者: shiyiming 时间: 2008-11-2 22:42
标题: Re: 样品聚类分析中对距离的定义
maybe the METHOD= option in PROC CLUSTER
<a class="postlink" href="http://support.sas.com/onlinedoc/913/getDoc/en/statug.hlp/cluster_sect4.htm">http://support.sas.com/onlinedoc/913/ge ... _sect4.htm</a>

作者: shiyiming 时间: 2008-11-3 12:21
标题: Re: 样品聚类分析中对距离的定义
非常感谢您（urchin）！看后您发的资料，我基本明白了要在输入的数据集名称后面加上（type=distance), 但现在我还不会利用sas计算样品聚类分析中各种距离系数的计算程序，如卡方距离，因我的分析中想使用卡方距离，而在样品聚类分析中默认的坐标数据和欧氏距离，不知如何利用sas程序计算样品间的卡方距离，请您指教！谢谢！

作者: shiyiming 时间: 2008-11-3 14:03
标题: Re: 样品聚类分析中对距离的定义
To customize the distance function, PROC DISTANCE may be considered.
<a class="postlink" href="http://support.sas.com/onlinedoc/913/getDoc/en/statug.hlp/distance_index.htm">http://support.sas.com/onlinedoc/913/ge ... _index.htm</a>

作者: shiyiming 时间: 2008-11-21 10:46
标题: Re: 样品聚类分析中对距离的定义
再次感谢您（urchin）！根据您发的资料，这一段时间我在摸索，已能写出相关程序作此类分析，谢谢您！

作者: shiyiming 时间: 2008-11-21 23:18
标题: Re: 样品聚类分析中对距离的定义
SAS目前给出了11种距离定义的方法，你说的卡方是哪一种呢？

作者: shiyiming 时间: 2008-11-22 13:16
标题: Re: 样品聚类分析中对距离的定义
距离的定义很多，最常见是欧氏距离，卡方距离（ｃｈｉ　ｓｑｕａｒｅ　ｄｉｓｔａｎｃｅ）是其中的一种．样品聚类的方法很多，用来计算类与类之间的距离，如类平均法，最长距离法，最短距离法等．有关详细情况请阅读ｕｒｃｈｉｎ所发的资料，他是高手．

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